近日，兽医学院博士研究生蔡钟鹏以第一作者身份在在环境与健康领域权威期刊Journal of Hazardous Materials（中科院一区Top期刊）上发表了题为“From farm to fork: Transmission dynamics of carbapenem-resistant Enterobacterales in broiler production chain and implications for public health”的研究论文。该研究系统揭示了肉鸡生产链中产NDM的碳青霉烯耐药肠杆菌（NDM-CRE）的传播规律、源头及其对食品安全的潜在威胁，并基于连续监测和基因组分析，首次提供了NDM-CRE“从农场到餐桌”传播的直接证据。
碳青霉烯类药物被视为医学临床抗感染的“最后一道防线”，虽未批准用于食品动物，但动物源CRE的检出率持续上升，其源头、传播路径和公共卫生风险不清。为深入解析传播链条，研究团队对三个肉鸡场开展纵向监测，覆盖了从上游种鸡场、孵化场到下游屠宰场、市场的完整链条，共收集了7372份样本用于分离NDM-CRE，并对其中861株代表性NDM-CRE分离株进行全基因组测序。结果显示，NDM-CRE污染率沿生产链显著升高，种鸡场和孵化场环节为10.8%，肉鸡场环节升至43.4%，屠宰和零售环节则高达61.6%。全基因组分析进一步发现：（1）养殖场空栏期环境中残留的NDM-CRE可在雏鸡进场后数小时内迅速定植肠道；（2）孵化场是养殖场NDM-CRE的关键来源；（3）通过从养殖场连续追踪至下游屠宰场与零售市场，获得了NDM-CRE 沿“养殖场-屠宰场-市场零售肉”传播的直接证据。值得注意的是，养殖场部分菌株与医学临床分离株高度同源，提示耐药菌可在“人–动物–环境”之间传播，凸显了基于“One Health”理念开展细菌耐药性防控的紧迫性。
研究团队进一步评估了全国肉鸡生产链NDM-CRE的污染情况，发现93.5%的肉鸡场、88.5%的种鸡场、56.7%的孵化场及46.2%的蛋鸡场检测出NDM-CRE。
该研究明确了肉鸡生产链中CRE的主要源头与传播路径，指出空栏期环境消毒、孵化场生物安全强化和屠宰环节微生物控制是阻断耐药菌传播的关键节点，为制定覆盖畜禽生产全链条的耐药性综合防控策略、保障畜牧业可持续发展与食品安全提供了关键科学依据。
兽医学院2023级博士生蔡钟鹏、2020级硕士生普文仙和青年教师刘艺云副教授为论文共同第一作者，刘健华教授、中国农业大学汪洋教授和香港理工大学陈声教授为论文共同通讯作者。研究得到了国家重点研发计划（2022YFC2303900）和国家自然科学基金专项项目（32141002）等的支持。
相关论文链接：https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2025.140859
文图/兽医学院
