近日，动物科学学院家禽遗传育种研究团队在Journal of Advanced Research（中科院一区TOP期刊，最新影响因子13）在线发表了题为“Whole-genome sequencing identifies genetic diversity and adaptive signatures of hypoxia and ultraviolet radiation in Chinese chickens”的研究论文，为高/低海拔鸡种的种群分化提供了遗传学证据。
家鸡起源于红原鸡，我国地方鸡种在复杂多样的生态环境中形成了丰富多样的遗传资源。本研究整合我国5个地方鸡种的118 份全基因组测序数据及全球295份公共数据库的鸡基因组数据，通过π、Tajima’s D、XPEHH等选择信号分析方法，揭示高海拔鸡种适应性进化机制。结果显示，高海拔鸡种遗传多样性降低，有效种群规模呈下降趋势。共鉴定出9个强正向选择基因组区域，富集了与缺氧和紫外线辐射响应相关的基因。其中，TPK1、BAZ2B、MARCHF7等5个关键基因可能在缺氧环境生理适应过程中发挥关键作用。本研究揭示了高海拔鸡种适应极端环境的遗传机制，为高/低海拔鸡种的种群分化提供了遗传学证据。
华南农业大学动物科学学院已出站博士后Semiu Folaniyi Bello、埃塞俄比亚阿尔西大学Endashaw Terefe博士、华南农业大学博士生叶浩强和中国科学院昆明动物研究所Adeniyi Charles Adeola博士为论文共同第一作者，华南农业大学聂庆华教授、英国诺丁汉大学Olivier Hanotte教授和华南农业大学蔡柏林副教授为该论文的共同通讯作者，张细权教授为共同作者。该研究得到了国家重点研发计划项目、农业生物育种国家科技重大专项、广东特支计划畜禽种业自主创新团队项目等项目的资助。
相关论文信息：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2090123225010173
文图/动物科学学院
