7月3日，学校国家生猪种业工程技术研究中心/猪禽种业全国重点实验室吴珍芳教授课题组在国际知名学术刊物Nature Communications在线发表题为“Multi-omic characterization of allele-specific regulatory variation in hybrid pigs”的的研究论文。
现代养猪产业普遍采用专门化品系选育和配套系杂交，其目的是充分利用杂种优势。基因表达调控是将基因型转化为表型的关键步骤，而猪等位基因特异性表达（Allele-specific expression，ASE）现象被认为是引起猪杂种优势和遗传多样性的潜在机制。ASE与亲本基因型效应密切相关，并受复杂的顺式/反式作用调控，通常被认为在解释杂种和亲本之间基因表达差异方面起着关键作用。然而，大多数研究仅关注稳态RNA丰度，忽略了在不同组织和发育阶段的多层次基因调控变异。对ASE的系统性研究，不仅有助于完善基因表达调控的遗传解析，还为猪杂交育种和复杂疾病的机制研究提供了重要依据。
中西方猪“正反交”等位基因特异性表达实验设计
项目组设计了中西方猪种正反交杂交配套实验，首次系统研究了ASE的时空特异性，揭示了猪在不同发育时期、不同组织中的亲本决定型（Parent-of-Origin Effect, POE）和等位基因型决定型（Allele Genotype Effect, AGE）两种ASE类型，鉴定了174个POE基因（其中154个为首次报道）和394个AGE基因（猪中首次系统报道），并绘制了猪不同发育阶段和不同组织特异性ASE图谱。发现在鉴定出的两类ASE基因中，POE基因与基因组印记相关，在猪早期胚胎发育、疾病的易感性和免疫性、肌肉骨骼生长发育过程中起到关键的调控作用；而AGE基因被认为可能与杂交优势相关，可作为种猪杂交配套、基因组选配的重要参考依据。
PEG10、PM20D1与IGF2R基因发生等位基因特异性表达的遗传机制
我校动物科学学院吴珍芳教授、杨杰副研究员，美国密歇根州立大学黄温助理教授为本文共同通讯作者，我校蔡更元研究员、博士后全建平、博士毕业生王兴旺，仲恺农业工程学院杨明高级畜牧师为共同第一作者。
相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41467-024-49923-5
文图/动物科学学院
